我们是一家商业贸易公司，由于铁路车皮计划是总公司统一调配的，拿到手的铁路运费发票上，托运人是供货方，收货人变成了总公司，这样的运输发票我们公司能入账抵扣吗？若不能入账抵扣，我们公司该作如何处理？

答：根据《财政部、国家税务总局关于增值税若干政策的通知》（财税〔2005〕165号）第七条第（一）款规定：“一般纳税人购进或销售货物（东北以外地区固定资产除外）通过铁路运输，并取得铁路部门开具的运输发票，如果铁路部门开具的铁路运输发票托运人或收货人名称与其不一致，但铁路运输发票托运人栏或备注栏注有该纳税人名称的（手写无效），该运输发票可以作为进项税额抵扣凭证，允许计算抵扣进项税额。”

根据这一规定，你公司如果能取得托运人栏或备注栏注有你公司名称的（手写无效）铁路运输发票，则可以计算进项税额抵扣，如果没有注明你公司名称，则相关支出不能作为你公司的可抵扣运费支出。